Onderzoeksproject Identificatie en karakterisering van avirulentiegenen in Puccinia horiana
Algemeen kader
Chrysantenroest wordt veroorzaakt door de schimmel Puccinia horiana. Door de dalende beschikbaarheid van erkende fungiciden dient de beheersing van deze ziekte steeds meer te steunen op resistentieveredeling. Hierbij moeten de veredelaars, waarvan de beste in Vlaanderen en Nederland zitten, rekening houden met de aanwezigheid van verschillende pathotypes binnen P. horiana. Pathotypes zijn varianten die op sommige chrysanten cultivars wel en op andere dan weer geen ziekte veroorzaken. Dit project focust op de identificatie van de onderliggende genen van deze pathotypes, namelijk de avirulentie effectorgenen. Hun identificatie zal later toelaten om bestaande en nieuwe pathotypes van deze schimmel snel te karakteriseren en zo op termijn een meer gerichte en duurzame resistentie te realiseren bij de veredeling van pot- en snijchrysanten.
Onderzoeksaanpak
De ILVO collectie van P. horiana isolaten zal worden uitgebreid met potentieel relevante isolaten. Het pathotype van deze isolaten zal bepaald worden door screening op een gevarieerde set van cultivars, zowel pot- als snijchrysanten. Van de relevante isolaten zal uit verzamelde basidiosporen zuiver DNA worden bereid, dat dan gebruikt zal worden om de volledige genoomsequentie van de isolaten te bepalen. De studie en vergelijking van deze genomen zou moeten toelaten om in te zoomen op kandidaat effectorgenen. De meest beloftevolle kandidaat effectorgenen zullen gekarakteriseerd worden.
Relevantie/Valorisatie
Chrysantenroest is de belangrijkste ziekte bij zowel pot- als snijchrysanten. Potchrysant is traditioneel belangrijk voor Vlaanderen, met o.a. toonaangevende veredelingsbedrijven. Snijchrysant is wereldwijd de tweede belangrijkste snijbloem (na roos, nauw gevolgd door anjer), met een marktwaarde van ongeveer 5 miljard €. De veredeling daarvan is voornamelijk gesitueerd in Nederland.
De resultaten zullen in eerste instantie doorstromen naar de belangrijkste veredelaars van pot- en snijchrysanten in Vlaanderen en Nederland. Zij kunnen de resultaten als geen andere rechtstreeks implementeren in hun veredelingsprogramma’s. Het project omvat een doctoraatsstudie, waardoor wetenschappelijke resultaten ook zullen doorstromen via publicaties. Er is een kans dat een deel van de resultaten vertaald kunnen worden naar andere schimmelroesten, zoals de belangrijke graanroesten.
