Onderzoeksproject Validatie van diagnostiek en methoden voor epidemiologische monitoring van Ralstonia

Algemeen kader

Dit project duikt diep in het plantschadelijke Ralstonia solanacearum species complex (RSSC). Er zijn het laatste decennium namelijk ‘exotische’ stammen van dit bacteriecomplex opgedoken in onze contreien. Het RSSC wordt beoordeeld als een quarantaine-pathogeen met een ‘zero-tolerance’ beleid. De daarbij horende monitoringinspanningen door de diensten voor plantenbescherming hebben baat bij een beter begrip van de epidemiologie van dit bacteriecomplex. Wetenschappelijke experts kunnen hiervoor actuele kennis en technieken ter beschikking stellen via dit project.

Bacteriën behorend tot het RSSC zijn bekend als veroorzaker van verwelkingsziekte bij gewassen als aardappel en tomaat, en in sierplanten zoals Pelargonium en Anthurium. Het RSSC omvat vier fylotypes die in drie verschillende soorten zijn ingedeeld: R. solanacearum (fylotype II), R. pseudosolanacearum (fylotypes I en III) en R. syzygii (fylotype IV). Het bekendste in de EU is R. solanacearum fylotype IIB sequevar 1 (IIB-1) omwille van zijn historische rol als veroorzaker van bruinrot in aardappel. Maar het is R. pseudosolanacearum fylotype I, traditioneel beschouwd als ‘tropisch’, die sinds 2015 schade blijkt te kunnen aanrichten in de productie van Europese sier- en kruidenplanten, en dus een groep is geworden die zich aanpast aan gematigde klimaten.

Onderzoeksaanpak

De onderzoekers zetten, in samenwerking met het internationaal Euphresco-netwerk, een samenwerkingsplatform op rond de diagnostiek, pathologie en epidemiologie van de ‘tropische’ soorten R. pseudosolanacearum en R. syzygii. Ze mikken op een bredere kennis van de genetische diversiteit, populatiestructuur en evolutionaire dynamiek van R. pseudosolanacearum en R. syzygii. Bovendien wordt ingezet op de harmonisatie van detectie- en identificatiemethoden. De taak van het ILVO-bacteriologieteam is de inventarisatie van bacteriële stammen, status updates betreffende het voorkomen van de twee ‘exotische’ Ralstonia soorten in België, de validatie van diagnostische methoden, de beoordeling van typeringsmethoden op basis van volledige genoomsequenties, en de lancering van een interactieve tool voor epidemiologische monitoring.

Relevantie/Valorisatie

Verschillende plantensoorten die worden aangetast door Ralstonia bacteriën zijn van economisch belang voor de EU. De resultaten van dit onderzoekswerk gaan rechtstreeks renderen in de monitoringinspanningen in het kader van de huidige regulering als quarantaine-pathogeen. De bevoegde autoriteiten krijgen extra handvaten om de potentiële impact van Ralstonia op de lokale land- en tuinbouw te beperken.

Financiering

FOD Volksgezondheid, Veiligheid van de voedselketen en Leefmilieu